PHP のバージョンは何を使っていますか。漢字コードを扱うライブラリに問題がある版 (4.2.3など) を使っているとそういう問題が起こるかもしれません。

ちなみに、メールは、XOOPS のコードをそのまま使っているだけなので、XOOPS 本体の通知メールも文字化けしていると思います。
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Nobuhiro YASUTOMI (MySite Users Webmaster)