アップロードしたフォルダがおかしなパーミッションになっているとかないですか? あるいは、.htaccess などが置いてあるなど。

私自身は、そのような障害をまったく見たことがないので一般的なことしか言いようがないのです。
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安冨　伸浩 (マイサイト管理人)