いつもお世話になっています。

イベント案内モジュール2.53をいくつか複製して使用させていただこうと思っています。
モジュールの複製は、サーバ管理者にお願いしてすでに複製できているのですが、それぞれのメールテンプレートをカスタマイズしようとして、一つのeguideのテンプレートをftpにてアップしたところ、他のすべての複製したeguideのテンプレートが同時に書き換わってしまいました。
具体的には、language/japanese/main.php とlanguage/japanese/mail_template/accept.tplです。

サーバ管理者のおっしゃるには、eguideの複製がduplicate.php によるハードリンクのためではないか、ということなのですが、複製したeguideごとに独自のメールテンプレートを持たせる方法はありますでしょうか。

ご教示のほど、よろしくお願いいたします。