大変お世話になっております。
さて、特異なケースだとは存じ上げますが、
セキュリティー向上を目的として、
ディレクトリー名に「半角スペース文字(空白文字)」を
あえて挿入して、そんなディレクトリー名を含んだ
圧縮化アーカイブファイルを当サイトでアップロードし、
自動解凍展開しますと・・・・・
「２種類のディレクトリーが表示される」
「ディレクトリーに接続するとディレクトリー名称から空白が無くなる」

またファイル名として「半角スペース文字(空白文字)」を
含めたファイルを生成すると、消せなくなる。

非常に希少なことだとは存じ上げますが、
スクリプト内のファイル名称なりディレクトリー名称に
ダブルクオーテション文字で囲んでいただけると、
問題にならないかとは存じ上げます。如何なものでしょうか？
お手数をお掛けするのも心外ですので、仕様であれば諦めます。