XCL 2.1 と仮定しての hack です。
「最近のコメント」ブロックで、コメントを表示するモジュールの指定 (ブロックの編集でディレクトリ名をカンマ区切りで並べる) ができるようになります。
--- modules/legacy/blocks/legacy_comments.php~	2007-06-24 23:58:46.000000000 +0900
+++ modules/legacy/blocks/legacy_comments.php	2008-10-24 16:02:55.317793487 +0900
@@ -24,13 +24,25 @@
     include_once XOOPS_ROOT_PATH.'/include/comment_constants.php';
     $comment_handler =& xoops_gethandler('comment');
     $criteria = new CriteriaCompo(new Criteria('com_status', XOOPS_COMMENT_ACTIVE));
+    $module_handler =& xoops_gethandler('module');
+    $modules =& $module_handler->getObjects(new Criteria('hascomments', 1), true);
+    if (!empty($options[1])) {
+	$accept = explode(',', $options[1]);
+	$mids = array();
+	foreach ($modules as $module) {
+	    if (in_array($module->getVar('dirname'), $accept)) {
+		$mids[] = $module->getVar('mid');
+	    }
+	}
+	if ($mids) {
+	    $criteria->add(new Criteria('com_modid', '('.join(',', $mids).')', 'IN'));
+	}
+    }
     $criteria->setLimit(intval($options[0]));
     $criteria->setSort('com_created');
     $criteria->setOrder('DESC');
     $comments =& $comment_handler->getObjects($criteria, true);
     $member_handler =& xoops_gethandler('member');
-    $module_handler =& xoops_gethandler('module');
-    $modules =& $module_handler->getObjects(new Criteria('hascomments', 1), true);
     $comment_config = array();
     foreach (array_keys($comments) as $i) {
         $mid = $comments[$i]->getVar('com_modid');
@@ -61,7 +73,9 @@
 
 function b_legacy_comments_edit($options) {
     $inputtag = "<input type='text' name='options[]' value='".intval($options[0])."' />";
-    $form = sprintf(_MB_LEGACY_DISPLAYC, $inputtag);
+    $inputmod = "<input type='text' name='options[]' value=\"".htmlspecialchars($options[1])."\" />";
+    $form = sprintf(_MB_LEGACY_DISPLAYC, $inputtag)."<br/>".
+	sprintf(_MB_LEGACY_DISPLAYMOD, $inputmod);
     return $form;
 }
 ?>
--- modules/legacy/language/japanese/blocks.php	2007-05-25 15:05:02.000000000 +0900
+++ modules/legacy/language/japanese/blocks.php	2008-10-24 15:40:17.201485967 +0900
@@ -26,6 +26,7 @@
 define("_MB_LEGACY_LOGO",    "%s ディレクトリ内のロゴファイル名");  // %s is your root image directory name
 define("_MB_LEGACY_SADMIN",  "管理者グループを表示する");
 define("_MB_LEGACY_DISPLAYC","%s 件表示する");
+define("_MB_LEGACY_DISPLAYMOD","表示モジュール %s");
 
 define("_MB_LEGACY_LANG_NUMTHEME", "%s テーマ");
 define("_MB_LEGACY_LANG_THSHOW", "スクリーンショット画像の表示");
まあ、設定ミスもあり得るので、あまりお勧めしませんが。

お勧めは、一般モジュールのコメントは d3forum のコメント統合にしてしまい、xoopsのコメント機能は ccenter 専用にしてしまう方法。