よく調べたら、担当者以外の通知設定が機能していませんでした。バグでございます。orz

以下のような修正で動くと思います。
--- index.php	21  9月 2008 18:00:22 +0900	1.19
+++ index.php	11  3月 2009 21:54:48 +0900	
@@ -200,7 +200,8 @@
     $tags['MSG_URL'] = ($store==_DB_STORE_NONE)?'':"\n"._MD_NOTIFY_URL."\n".$msgurl;
 
     $notification_handler =& xoops_gethandler('notification');
-    $notification_handler->triggerEvent('global', $id, 'new', $tags);
+    $notification_handler->triggerEvent('global', 0, 'new', $tags);
+    $notification_handler->triggerEvent('form', $form['formid'], 'new', $tags);
     // force subscribe sender and recipient
     if ($id) $notification_handler->subscribe('message', $id, 'comment');
     if ($touid) {
自分を担当者にしてのテストばかりで、気がついていませんでした。
ご指摘ありがとうございます。