個人的にはエラーメッセージが読めない人が迂闊にデータベース操作を行うと、データの全消去も最悪の場合起こりえますので、お勧めできません。

fievarsty さんのおっしゃるように、 MediaWiki を最新版へアップグレードし、すべての Extension をコメントアウトしたうえで xxupdate.php を実行、その後に Extension ファイルを最新のものに差し替えたうえで xxupdate.php を実行してみてください。 最近、Extensionを新たに導入した場合はそれらが原因となっている可能性もございます。

残念ながら、エラーの詳細が不明であるため(原因が一つとは限られない。また、導入Extension の状況等も一切不明であるため)、具体的な回答までは致しかねます。