データが無くなる、という現象自体は確認できていないのですが、従来 (1.5以前) 定員に達したらフォームの表示を抑止する動作になっていたため、複数の人が同時にフォームに記入すると、途中で定員に達した場合に問題が起きることになりました。
もしかしたら原因が分かったかもしれません。
予約確定のメールが届いたときに、間違ってキャンセルのURLをクリックして、そのままキャンセル処理をしてしまったら、予約確認メールは届いているのにサーバーに記録がない、ってことになりますよね。
キャンセル確認メールを送るとか、サーバーからデータを消さずに、キャンセル処理が行われたフラグだけをたてる(管理者はデータを見られる)ようにすれば、問題がなくなるかもしれません。
あくまで推測ですが....